Povestea din S.T.A.L.K.E.R. Clear Sky îi aduce pe jucători cu un an înainte de evenimentele din jocul original S.T.A.L.K.E.R. în 2011. Un grup de stalkeri a ajuns pentru prima dată în inima Zonei - Centrala Nucleară de la Cernobîl și provoacă un cataclism în pragul unei catastrofe. O explozie imensă de energie anormală schimbă Zona. Nu mai există drumuri fiabile și relativ sigure. Niveluri întregi dispar în izbucnirile de anomalii. Stalkerii și chiar expedițiile mor sau ajung pedepsiți pe teritoriile pierdute. Noi zone care au rămas necunoscute de la apariția Zonei apar pe harta Zonei. Zona continuă să se zguduie cu explozii. Zona este instabilă. Activitatea anormală este la maxim. Modificările hărții Zonei cunoscute de stalkeri zguduie echilibrul fragil al forțelor din Zonă. Între grupări izbucnesc ostilități pentru noile teritorii, câmpuri de artefacte și sfere de influență. Nu mai există vechi dușmani sau prieteni - acum fiecare este pentru el însuși. Războiul Facțiunilor a început între grupări. 10 ore de joc principal cu intriga 5 niveluri complet noi - Mlaștini, Pădurea Roșie, Spitalul în ruine, Limansk și Șantierul de Muniție Militară 8 niveluri semnificativ reproiectate față de jocul original - Cordon, Gunoiul, Valea Întunecată, Agroprom, Subteranul Agroprom, Armata și Stația Yantar Upgrade-uri pentru arme și armuri Posibilitatea de a repara armele Concepte actualizate despre anomalii și artefacte - anomaliile rare nu pot fi văzute și sunt descoperite cu ajutorul detectoarelor 36 de tipuri de arme 4 moduri de joc multiplayer 12 hărți multiplayer